由于我国地域辽阔，各地自然环境和发展水平差异很大，移动厕所建设和管理整体水平低、历史欠账大，几千年的传统陋习更是根深蒂固。
　　因此移动厕所工作也还存在着一些问题和困难，主要有：厕所革命涉及旅游、住房建设、国土资源、交通、环保、电力、市政等众多部门，部门之间协调难度较大。
　　移动厕所需投入的资金量较大，据估算仅建设资金需投入达数百亿元，资金短缺问题比较普遍，特别是经济欠发达地区资金缺口较大，资金来源渠道较少，影响部分厕所建设进度。
　　移动厕所项目建设审批环节较多，手续繁杂。在厕所的规划、立项、审批、用地等方面办理时间较长，影响了厕所建设进度。我国西部地区面积辽阔，景区间距离长，厕所建设地点远离城镇，缺少给排水管网等配套设施，施工难度大；部分地区水资源匮乏，特别是高寒、山地等地区的厕所建设面临较大困难，取暖、用电、用水等难以保障。五是使用厕所不文明、不爱护设施设备的现象比较突出，如厕人员整体素质参差不齐，移动厕所用品破损率和易耗品折损率较高等。
　　实施移动厕所文明提升行动。加强舆论宣传、监督和引导，利用旅游重大活动、重要时间节点，采取多种途径，深入开展厕所革命宣传。组织开展厕所日活动，在主流媒体上开辟旅游厕所专栏，举办厕所革命大讨论，不断加大新闻宣传力度，营造积极的舆论氛围；组织媒体对厕所革命进行明察暗访，加强舆论监督，不断推动地方工作的改进。

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